Qu’est-ce que la transcriptomique et pourquoi l’étudier ?
La transcriptomique permet de déterminer quels gènes sont activement exprimés, à quel moment et dans quelles conditions. Grâce aux technologies de séquençage haut débit, elle offre une vision complète et quantitative de l’activité génique, aussi bien chez les organismes procaryotes qu’eucaryotes.
C’est aujourd’hui l’une des méthodes les plus puissantes pour comprendre les réponses cellulaires à un stress, un traitement, un environnement ou un stade de développement.
Nos applications RNA-Seq
Notre offre couvre l’ensemble des besoins en analyse transcriptomique :
- Étude de l’expression différentielle entre conditions ou traitements
- Quantification de l’abondance des transcrits (ARNm)
- Annotation fonctionnelle des gènes exprimés
- Détection de variants ponctuels (SNP) à partir des transcrits
- Intégration multi-omique avec les données génomiques ou métagénomiques
Vous souhaitez cibler quelques gènes d’intérêt ? Nous proposons également des solutions de quantification par RT-qPCR, une solution ciblée, rapide et économique.
Workflow RNA-Seq : de l’échantillon aux résultats
Design expérimental
Extraction ARN
Protocoles optimisés
Séquençage
Analyse d'expression différentielle
Rapport physique & synthétique
Equipe scientifique dédiée par projet.
Assistance à l’élaboration du plan expérimental et de la stratégie de séquençage
Deux méthodes sont utilisées pour enrichir la fraction d’ARN d’intérêt (ARNm) avant la synthèse d’ADNc et la préparation de librairies :
- À partir d’ARN total eucaryote : Capture des ARNm par leur queue polyA
- À partir d’ARN total procaryote ou eucaryote : Déplétion des ARNr grâce à leur capture par des sondes complémentaires. Enrichissement des échantillons en ARNm.
Traitement complet des données de séquençage
Analyse d’expression différentielle
Analyse d’enrichissement fonctionnel
Rendus interactifs pour une exploration intuitive de vos données :
- Visualisations dynamiques (graphiques, Tableaux)
- Outils de filtrage et de tri pour cibler les gènes ou voies métaboliques d’intérêt
Interprétation des résultats et accompagnement personnalisé pour une prise en main autonome